A recent change in CallbackHandler added some internal stuff that breaks the way LibBars clears all registrations. The below patch reportedly fixes the issue:

Index: LibBars-1.0.lua
===================================================================
--- LibBars-1.0.lua    (revision 17)
+++ LibBars-1.0.lua    (working copy)
@@ -1059,21 +1059,15 @@
        self.timerLabel:SetFont(f s or 10, m)

        -- Cancel all registered callbacks. CBH doesn't seem to provide a method to do this.
-       if self.callbacks.insertQueue then
-               for eventname, callbacks in pairs(self.callbacks.insertQueue do
-                       for k, v in pairs(callbacks) do
-                               callbacks[k] = nil
-                       end
-               end
-       end
-       for eventname, callbacks in pairs(self.callbacks.events do
-               for k, v in pairs(callbacks) do
-                       callbacks[k] = nil
-               end
-               if self.callbacks.OnUnused then
-                       self.callbacks.OnUnused(self.callbacks, target, eventname)
-               end
-       end
+        local listeners = {}
+        for eventname, callbacks in pairs(self.callbacks.events do
+            for listener, callback in pairs(callbacks) do
+                listeners[listener] = true
+            end
+        end
+        for listener, _ in pairs(listeners) do
+            self.UnregisterAllCallbacks(listener)
+        end
 end

 function barPrototype:GetGroup()